Înainte de a fi transformat în muzeu de istorie, clădirea Palatului Administrativ din Botoșani a fost dotată cu sistem electric și încălzire centrală, făcându-l prima clădire din zonă cu astfel de facilități. O atracție impresionantă este candelabrul în stil Ludovic al XVI-lea, realizat la Paris, care strălucește și astăzi în Sala Mare, cunoscută și sub numele de Sala Oglinzilor. Această sală impresionează prin înălțimea sa și prin aspectul somptuos, fiind decorată cu lambriuri de lemn de stejar și scuturi din stucaturi care afișează stema județului. Plafonul decorat cu stucaturi și friză pastelată completează imaginea feerică. În aceeași sală se poate admira un tablou monumental realizat de Artur Verona, la comanda Prefecturii, care redă o scenă câmpenească inspirată de stema județului, cu o dimensiune impresionantă de 3,75 m x 2,70 m.
Muzeul de istorie dispune de 16 săli în care sunt expuse aspecte ale istoriei locale, începând de la perioada preistorică și continuând cu cele mai importante epoci ale istoriei botoșănene. Piesele de preistorie sunt cu adevărat impresionante, inclusiv arme din piatră și os, resturi fosile de animale preistorice și un adăpost reconstituit din paleolitic, un exemplu unic în zonă. Cultura Cucuteni este prezentată prin numeroase artefacte unice prin modul de realizare și decorul lor. Piesele ce aparțin acestei civilizații sunt deosebit de importante pentru zona în care se află muzeul. Perioada medievală este ilustrată prin bijuterii, tezaure monetare și documente care atestă dezvoltarea zonei. Epoca modernă este prezentată prin documente originale care dezvăluie dezvoltarea economică, politică și socială a județului Botoșani în perioada dintre cele două războaie mondiale.